Координацията и контролът на дейността в областта на железопътния транспорт се осъществяват от Изпълнителна агенция "Железопътна администрация" със седалище София и с териториални звена. Изпълнителната агенция "Железопътна администрация" е регулаторен орган в железопътния транспорт. Изпълнителна агенция "Железопътна администрация" е национален орган по безопасността в железопътния транспорт. Изпълнителна агенция "Железопътна администрация" е орган за контрол по прилагането на Регламент (ЕО) № 1371/2007 на Европейския парламент и на Съвета от 23 октомври 2007 г. относно правата и задълженията на пътниците, използващи железопътен транспорт.

Изпълнителната агенция "Железопътна администрация":

•     контролира достъпа до железопътната инфраструктура и изпълнението на задълженията за обществени услуги;
•     проверява изпълнението на изискванията за издаване на лицензии и разрешения;
•     събира такси за издаване на лицензиите и разрешенията, както и за издаване на удостоверения за безопасност, документи за правоспособност и за признаване на правоспособност и удостоверения за консултанти по сигурността на превозите на опасни товари, в размер, определен от Министерския съвет по предложение на министъра на транспорта, информационните технологии и съобщенията;
•     издава документи за правоспособност на персонала в железопътния транспорт;
•     води регистри и набира статистически данни за дейностите в железопътния транспорт;
•     разработва и предлага на министъра на транспорта, информационните технологии и съобщенията проекти на нормативни актове в областта на железопътния транспорт;
•     осъществява контролни функции по този закон, включително по отношение въвеждането в експлоатация на структурни подсистеми на железопътната система;
•     предлага на министъра на транспорта, информационните технологии и съобщенията за одобряване мерки за предотвратяване и преодоляване на последиците от бедствия и аварии, засегнали железопътната инфраструктура;
•     съгласува проектите за пресичане на железопътните линии от железопътната инфраструктура с пътищата от републиканската пътна мрежа, местните пътища, улиците, тръбопроводите, кабелните и въздушните високоволтови и нисковолтови линии и други, както и проектите за свързване на железопътните линии от железопътната инфраструктура;
•     изпълнява и други функции, възложени й със закон или с акт на Министерския съвет.

Закон за железопътния транспорт
Обн. ДВ бр. 97 от 2000 г. , изм. ДВ бр. 47 от 2002 г. , изм. ДВ бр. 96 от 2002 г. , изм. ДВ бр. 70 от 2004 г. , изм. ДВ бр. 115 от 2004 г. , изм. ДВ бр. 77 от 2005 г. , изм. ДВ бр. 88 от 2005 г. , изм. ДВ бр. 36 от 2006 г. , изм. ДВ бр. 37 от 2006 г. , изм. ДВ бр. 62 от 2006 г. , изм. ДВ бр. 92 от 2006 г. , изм. ДВ бр. 108 от 2006 г. , изм. ДВ бр. 22 от 2009 г. , изм. ДВ бр. 35 от 2009 г. , изм. ДВ бр. 74 от 2009 г. , изм. ДВ бр. 81 от 2009 г. , изм. ДВ бр. 87 от 2010 г. , изм. ДВ бр. 47 от 2011 г. , изм. ДВ бр. 15 от 2013 г. , изм. ДВ бр. 68 от 2013 г. , изм. ДВ бр. 17 от 2015 г. , изм. ДВ бр. 47 от 2015 г. , изм. ДВ бр. 19 от 2017 г. , изм. ДВ бр. 58 от 2017 г. , изм. ДВ бр. 96 от 2017 г. , изм. ДВ бр. 103 от 2017 г. , изм. ДВ бр. 17 от 2018 г. , изм. ДВ бр. 77 от 2018 г. , изм. ДВ бр. 20 от 2019 г. , изм. ДВ бр. 62 от 2019 г. , изм. ДВ бр. 79 от 2020 г. , изм. ДВ бр. 11 от 2021 г.

Устройствен правилник на изпълнителната агенция
Обн. ДВ бр. 61 от 2001 г. , изм. ДВ бр. 15 от 2010 г.